Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms