Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nfe2Q07279 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nfe2Q07279 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms