Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Siah1bQ06985 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Siah1bQ06985 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms