Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cab39Q06138 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cab39Q06138 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cab39Q06138 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cab39Q06138 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cab39Q06138 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cab39Q06138 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cab39Q06138 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cab39Q06138 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cab39Q06138 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms