Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPINDOCQ05AH6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms