Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PtprgQ05909 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprgQ05909 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms