Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col9a1Q05722 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms