Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox9Q04887 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms