Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox8Q04886 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms