Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnb1Q03717 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms