Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccl7Q03366 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms