Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Msx2Q03358 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msx2Q03358 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms