Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms