Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Htr1fQ02284 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Htr1fQ02284 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms