Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme2Q01768 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms