Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sec23aQ01405 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sec23aQ01405 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms