Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grin2cQ01098 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grin2cQ01098 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms