Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrcdQ00LT2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrcdQ00LT2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms