Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VegfaQ00731 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VegfaQ00731 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms