Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SeleQ00690 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SeleQ00690 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms