Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga4Q00651 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms