Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GabpaQ00422 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms