Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou1f1Q00286 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms