Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx2Q00262 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx2Q00262 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms