Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PgrQ00175 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PgrQ00175 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms