Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfcP97953 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfcP97953 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfcP97953 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfcP97953 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfcP97953 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VegfcP97953 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms