Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx3-2P97503 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms