Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmklr1P97468 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmklr1P97468 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms