Protein–RNA interactions for Protein: P97382

Kcnab3, Voltage-gated potassium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab3P97382 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnab3P97382 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnab3P97382 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms