Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SmsP97355 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SmsP97355 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SmsP97355 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SmsP97355 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SmsP97355 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SmsP97355 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SmsP97355 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SmsP97355 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms