Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rps3aP97351 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps3aP97351 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms