Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RptnP97347 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RptnP97347 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RptnP97347 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RptnP97347 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RptnP97347 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RptnP97347 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RptnP97347 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RptnP97347 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RptnP97347 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RptnP97347 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RptnP97347 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms