Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrkdcP97313 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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