Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mesp1P97309 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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