Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbx1P82976 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms