Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gabpb2P81069 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gabpb2P81069 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms