Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Otx2P80206 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otx2P80206 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otx2P80206 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otx2P80206 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otx2P80206 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otx2P80206 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Otx2P80206 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otx2P80206 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Otx2P80206 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Otx2P80206 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Otx2P80206 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms