Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Otx1P80205 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms