Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8a1P70704 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms