Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tp53bp1P70399 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms