Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rad50P70388 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rad50P70388 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms