Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tbx6P70327 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx6P70327 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms