Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgif1P70284 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms