Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms