Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf6P70279 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Surf6P70279 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms