Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rad54lP70270 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms