Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxna3P70208 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxna3P70208 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms