Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4fP70194 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4fP70194 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4fP70194 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4fP70194 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4fP70194 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4fP70194 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4fP70194 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clec4fP70194 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Clec4fP70194 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms