Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf5P70191 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf5P70191 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms