Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Acta1P68134 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta1P68134 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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